（1）原本已经信仰切支丹的民众被允许保留信仰，但是不准再允许伴天连们发展新的信徒。
切支丹和切支丹结亲的，生下的孩子可以继续信奉，切支丹和其他信仰的对象结亲的，生下的孩子不能再信奉切支丹；
（3）大名如果出现交替、继承、转封的情况，民众要么随着先代主君转封，要么就地改信佛教或神道宗，都不愿意的需向官府提出申请，经批准后迁移至依然接纳切支丹的大名领内。
（4）知行超过知行超过200町，或收入3000贯以上的大名，或者知行超过80町收入超过1000贯的武士，在经过秀吉批准之后才能继续信奉切支丹，不然必须在限期内改信；
（6）天下各大名，需要严格限制领内切支丹家臣的数量，必须要留下接纳的也需要进行约束，经统计后上报秀吉核准。
从以上这些条例的修改可以看出，秀吉对于切支丹的警惕性比历史上高好多，历史上的秀吉对于切支丹虽然进行了一定的限制，但是并且有彻底堵死，特别是在民众的信仰上。
而这一世的秀吉对于切支丹的态度格外严厉，对信奉切支丹民众在基数上进行了限制，切支丹只有和切支丹成亲子嗣才能继续信奉切支丹，不然就必须改信，就从源头上封印了切支丹信众的上限。
包括第（3）点也是对切支丹信众进行了约束，将他们这群人制约在特定的地区，而当领主不再接纳切支丹后，他们要么改信，要么居家迁移。
正所谓故土难离，离开了土地的信众就是流民，到了新领恐怕过得还不如乞丐，秀吉希望用这条政策，减少现今信奉切支丹的人数。
同时，秀吉对于大名秀吉也比历史上严格好多，历史上的秀吉只是要求大名们有新出现想要改信切支丹的，报他批准就行，对于已经改信的并没有进行限制。
但是这一世，直接要求天下所有大名，不论是已经改信的还是即将改信的，都需要经过他的同意，不然就必须限期改信。
第（6）条更是要求其麾下的大名，帮助其对领内信奉切支丹的武士进行约束，很多大名都会因为惧怕秀吉的威严，或者懒得惹麻烦而要求已经信奉切支丹的武士改回信仰。
对于这些大名来说，如果出现不愿意改信的武士，正好可以以此为借口收回他们的知行，扩大自己的实力。
对于秀家来说，这道命令的影响力还好，因为秀家已经预料到这种情况的发生，将领内的切支丹领民大部分流放到了虾夷地。
现如今秀家正好可以借着《伴天连追放令》，强制将赖在土地上的切支丹民众装船北运。
如果说一定有影响的话，就是那些改信了切支丹的武士，过去秀家对于他们的信仰没有依据进行限制。
限制随着《伴天连追放令》是下达，秀家不仅可以对他们进行约束，在暗示他们接受转封琉球或者虾夷的安排，还能表现出这是对他们信仰私底下的接纳，使得他们对秀家感恩戴德。
唯一比较麻烦的是向明石全登这样的重臣，他的能力即便放在日本都是拔尖的，秀家不愿意刻意迫害逼迫他改信，搞不好直接把人给搞走了。
那么只剩下一条路了——假意改信。
秀家只能代其上报已经改信，并且私底下通知他以后低调一点，不要刻意的展现出切支丹的信仰，当然这一切都是打着保护他的名义。
如果说《伴天连追放令》对秀家来说的好处的话，就是秀家终于可以有明面上的理据，来限制切支丹在虾夷的发展。
《伴天连追放令》的下达，在短时间内引起了不小的波澜，特别是切支丹信徒遍布的九州地区，引发了一场席卷整个九州的一揆。
据说参与叛乱的民众数量超过10万众，以至于就封在九州的大名甚至没有能力进行镇压，以小早川隆景为首的外样大名联名上书秀吉，请求秀吉暂缓《伴天连追放令》的事实。
最后秀家不得不对《伴天连追放令》进行修改，暂时允许普通民众继续信奉切支丹，但是武士阶级必须进行约束，如果不愿意改变信仰的，就褪去武士的身份成为平民。
同时秀吉接纳了第一批允许继续接受切支丹信仰的名单，其中就有大友家，这就使得九州的切支丹民众蜂拥入北日向和丰后，短期内刺激了大友家的经济。
但是事实上，大友家现任家督大友义统是不信切支丹的，跟从他的家臣也大多信奉佛教，反倒是老家主大友宗麟是切支丹信徒，秀吉的这道命令为今后丰后动乱，大友家改易埋下了祸根。
与秀家多年内，不断的坚持清除领内切支丹信仰不同的是，天下大名过去普遍对切支丹信仰不加以约束，这就是的切支丹在日本各地深根发芽，从下至上的腐蚀日本。
因此当时限差不多到的时候，别国或多或少的上报了百余名家内信奉切支丹的武士，而横跨濑户内海，雄霸西国的冈山藩总共上报切支丹武士32名！
秀家的表现在之后新春贺喜中得到了秀吉的广泛赞誉，但是也为其打上了反切支丹大名的标签，使得秀家在之后与南蛮商人做生意的时候遇到了许多阻碍。
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