龚照玙跑了，看看留在旅顺的军官的表现，当时在旅顺的军官，全都是镇压太平天国起家的一干湘淮名将。张光前、黄仕林、姜桂题、程允和、卫汝成、赵怀业、徐邦道等诸将，这些人看不起龚照玙这种人，由总兵张光前出面召集诸将，推选出一个主帅。由资格最老的姜桂题出来承担主帅，可姜桂题目不识丁，才资平庸，诸军坐视观望、互相推诿。
这群人推举出一个目不识丁的老好人，依然是只为自己着想，其中徐邦道算是能打的将领了，守在主阵地上，不到半日就借口军队缺粮擅自离开，从李鸿章到淮军精英，都想着保存自己的实力，这场仗怎么打。其实如果能鼓起勇气，或者放下私心，淮军即便打不过日军，至少也不会将这种坚固要塞拱手让人。聂士成守凤凰岭就是例子，直到战争结束，他也没让日本人打下他的阵地，而他的軍队并不是什么精锐。
如果李鸿章能够在旅顺放一个能压得住场面的大将，日本人别说一天了，以他们还在使用青铜大炮的水平，一年都未必打的下来，可淮军老将刘铭传等人都不在这里，听说是重病在身，湘军老将刘锦棠也在这年病逝，无将可用是一大问题。但如果李鸿章能够下达严令，整个满清还是能找出一个大人物的，别的不说，派一个高级文官去旅顺，恐怕都比让这些武将互相推诿好的多，比如派一个兵部尚书去。
这种大方向山的指挥失当，责任应该由满清朝廷，或者说皇帝来负。
但旅顺之战，始终有一个迷局，那就是日军为什么在旅顺搞大屠杀？
如果说作战艰难，激怒了日军，这就是扯淡了，跟后来的日俄战争相比，这次旅顺之战几乎就没有战斗。
还有种说法，那就是日军为了震慑满清，效法蒙古人的政策，不希望看到抵抗。还是他们在朝鲜过的太好了，一路轻松推进，到了旅顺稍微遇到一点抵抗，就不满意了。
根据历史资料，是日本第一个进入旅顺的第一师团参谋长大寺安纯建议，使团长山地元治同意后，日军在旅顺发动了大屠杀，将旅顺城中两万多人杀尽。
这依然是军官的自行其是，不是伊藤博文等人的手段，不是给伊藤博文洗白，而是这种明显让日本出于国际道义不利地位的行为，日本政客是不会采取的。这场战争中，日本政客一直在试图让日本扮演一个文明国家的角色，他们允许了大量欧美记者随军采访，西方人看到的是日本建设合理的野战医院，不但医治日本伤员，还收容清军伤员，救治受伤百姓。而清军则是抢劫自己的老百姓，残杀日本俘虏，很多记者都拍下了被清军砍掉四肢，切掉了蛋蛋的日本俘虏尸体。因此随着战争的进行，日本在西方的形象越来越好，满清的野蛮形象越来越深入西方人的心理。
就在这时候，爆发了旅顺大屠杀，显然不是日本政府有意计划的，而且因为有大量随军记者，这件事连隐瞒都做不到。第一时间传遍了全世界。日本文官政府只能引导，而不能否认，最后的操作是，收买西方报纸，发表日本屠杀的都是装扮成老百姓的满清军人的谎言，最终随着满清战败而遮掩了过去。
但现在他们无法遮掩了，大明在世界上的影响力比日本大的多，大明搞宣传战的经验更丰富，在日本有确凿无疑的行为下，全世界都知道日本的屠杀行为，不但西方知道，大明还通过在整个中国的商业渠道，通过一个个大明的和满清的商会组织，将印刷的传单，传入了满清内陆，连四川的老百姓都知道，日本跟大清开战了，而且胜利后会屠城。此前一些偏远地区的百姓，甚至都不知道战争爆发的消息。
日本屠城的消息，通过报纸和传单，至少在整个中国地区的文人心理，留下了深深的恐慌，日本占了旅顺屠城，那么占了北亰呢，占了南京呢？
就在他们忧虑重重中，大明出兵了，并且在一个星期的激战之后，攻占了日军尚没有牢固控制的旅顺，明军付出了一万人的牺牲，两万五千日军，则战死了两万人，五千被俘虏。
攻占旅顺之前，大山岩等日本中高级将领集体切腹，五千俘虏中绝大多数是士兵，少数低级军官。
大明将日本军官的切腹，在全世界范围内宣传为畏罪自杀，同时在公开状态下，对俘虏的日本官兵进行了审判，判处他们犯有谋杀罪，所有军官一律枪决，普通士兵判处十年的苦役，发往大明殖民地服苦役。
世界舆论哗然，对大明将自己作为救世主一样的审判行为感到怪异，但各国政府关心的是，大明的军事行动，他们担心大明借此机会加入战争，火中取栗，占领满清领土。
但就在这时候，大明跟日本达成了协议，继续保持中立态度，开始从大连撤军，这种行为没有减轻西方人的疑惑，反而更让他们迷惑了起来。
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