而此时在豫南、湖广地区，大平军兵力其实也十分空虚。因此，周巡也只能分兵两路，他让张彪总领驻防的部队，自己则亲率熊捶镇一万四千兵马侧攻大顺军的残部。
相比较而言，这时大顺军在数量还是远远超过大平军，但是在连续大败之后，士气低落，撤退时又拉家带口，行动迟缓。正月二十九日，大顺军主力撤到房县后，在这里停留了较长的时间，直到薛勇部大平军追了上来时，才于三月十八日拔营南下。
而在这段较长的休整时期之中，李自成因怀疑李岩反叛，设伏诛杀李岩。李岩原配自尽。红娘子下落不明，有传闻说，她在江湖上隐居了起来。
而在穹源元年三月到四月，大平军先后在房县、保德、荆门、荆州、洪湖、咸宁、江西九江等七地，接战八次，大顺军都被击败。而这里所说的八次战役，并不都是大顺军主力同大平军展开的正面交锋，只是说了一些较大的战役。
四月，大顺军兵抵九江，南明镇守九江的左良玉告急。南明江西总督袁继咸以为大顺军将沿长江南岸向南京进军，就带了一部分军队赶往景德镇，同九江的左良玉部遥相呼应。
可是大顺军虽对上大平军是不堪一击，但对付南明的左良玉部却绰绰有余。大顺军主力在瑞昌大败左良玉部将马进忠、王允成的驻防军，使得弘光朝野大惊。
而左良玉也被吓得魂飞魄散，只好借着“北来太子”问题大做文章，打起清君侧的旗帜，声称要打到南京，讨伐阮大铖等人。（这事件将在后文详叙）。左军于四月二十三日全师东下后，九江遂无驻军，李自成乘机占领该城。
李自成当时的计划是夺取东南作为大顺军的根据地，所以为了集中力量，他就把沿途的各地留守的大顺军和其他各营农民军都编入到部队之中。可是这么一来，当周巡、薛勇部大平军尾追而来时，大顺军后方空虚，根本没有力量阻滞大平军前进。而李自成等人只能一路逃窜，连个休整的时间也找不到。
由于大顺军即没有留下较多的兵力扼守地方，又没有适时地组织必要的反击，只是一味地东进，这种顾前不顾后的做法终于招致了惨重的失败。五月，当大平军追至阳新富池口，趁大顺军不备冲入营垒，使大顺军又一次失利。
同月下旬，在距江西九江四十里处被大顺军攻入老营，大顺军久历战阵、功勋卓著的首号大将刘宗敏被俘，军师宋献策、明降将左光先、李自成的两位叔父赵侯和襄南侯以及大批随军的将领家属也被清军俘获。
由于不愿归降，怕麻烦的周巡就下令把刘宗敏和李自成的两位叔父斩杀，而宋献策和左光先投降。就在这前后，丞相牛金星也认为大势已去，竟然不告而别，开了小差。而牛金星的儿子牛佺原任大顺政权的商洛府尹，在大顺军节节败退的情况下，他也早就投降了大平朝，先被委任为大平朝知府，后来又逐渐升迁至大平朝的陕西巡抚。
而牛金星逃离大顺军后，一直住在牛佺的官衙里，享受着老太爷的清福，直至寿终正寝，竟然高龄八十三岁。真是一段戏剧人生啊！
六月初，李自成行至湖北通山县境九宫山下，突遭当地地主武装袭击。当时跟随在他身边的只有义子张鼐和二十八名战士。地主武装见兵马不多，就一拥而上。二十八名战士先后被击杀，李自成也在搏斗中命丧沙场。
真是其兴也勃焉，其亡也忽焉！
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